Des missions assignées aux Forces Aériennes découle l'organisation du Commandement des Forces Aériennes, qui est articulée de la manière suivante :
- Le Commandement Central assisté d'un Etat-Major, d'une Inspection, de Divisions d'Armes, de Directions de Soutien et de Bureaux Spécialisés ;
- Les Commandements Air au Niveau des Régions Militaires;
- Les Unités Aériennes;
- Les Bases Aériennes, Ecoles, Centres de Formation, Etablissements de Soutiens et Unités de Défense et de Protection.