La période Ottomane s'étend de 1516 à 1830, le visiteur pourra admirer les statues des frères Arroudj et Kheireddine Barberousse qui jouèrent un important rôle à secourir les villes côtières algériennes des offensives maritimes chrétiennes et espagnoles.

    Ces deux héros étaient de grands stratèges dans la guerre maritime, ce qui leur a permis à développer la flotte algérienne, devenue la plus grande puissance du bassin méditerranéen.

    Dans cet espace, une carte des opérations militaires de la flotte algérienne est exposée ainsi qu'une maquette de la ville de Bejaia, occupée par les espagnols en 1512 et libérée par Salah Rais en 1555. Des copies de traités entre l'Algérie et certains pays sont exposées:

• Traité Algéro-Anglais (1662) ;
• Traité Algéro-espagnol (1791) ;
• Traité Algéro- américain (1795).

    En plus des étendards de la flotte maritime algérienne :

• L'étendard du commandement;
• L'étendard d'un Amiral de la flotte;
• L'étendard du commandement général Capudane pacha.

    On retrouve des maquettes de l'époque comme le Fort de Tamentfoust, Fort Moulay Hassan pacha et le Fort de Mers-El- kebir à Oran.

    Le coup de l'éventail entre le Dey Hussein et le consul Duval, le 29 Avril 1827 fut un prétexte pour lancer l'expédition française contre l'Algérie en 1830.

    Le musée expose aussi une statue du grand amiral Rais Hamidou, ainsi que quelques types de navires qui constituaient la flotte algérienne (le Chebek et la Galère), armés de canons et réputés pour leur légèreté et leur rapidité.

    Ainsi que des toiles de batailles navales : la défaite de Charles Quint (1541), la bataille de Jijel (1664), la bataille de Hollande (1686), la Libération de Mers-El- Kebir (1791), occupé par les espagnols, la bataille contre les portugais (1802), bataille contre les anglais(1816), et enfin la bataille de Navarin (Avril 1827).